定 價(jià):128 元
叢書名:普通高等教育“十三五”規(guī)劃教材普通高等院校工程實(shí)踐系列規(guī)劃教材
- 作者:陳浩峰主編
- 出版時(shí)間:2016/6/1
- ISBN:9787030487919
- 出 版 社:科學(xué)出版社
- 中圖法分類:Q343.1
- 頁碼:360
- 紙張:膠版紙
- 版次:1
- 開本:32開
新一代基因組測序技術(shù)是目前生命科學(xué)領(lǐng)域中發(fā)展非?斓男录夹g(shù),它的出現(xiàn)極大地推動(dòng)了生物學(xué)、農(nóng)學(xué)和醫(yī)學(xué)診斷等學(xué)科各方面的發(fā)展,其應(yīng)用非常廣泛。本書以新一代基因組測序技術(shù)Illumina平臺(tái)和PacBioRS平臺(tái)為代表,詳細(xì)闡述了從實(shí)驗(yàn)樣品處理到數(shù)據(jù)分析的整個(gè)過程,重點(diǎn)介紹了新一代測序技術(shù)實(shí)踐過程中的文庫構(gòu)建與質(zhì)檢、測序儀器操作和測序數(shù)據(jù)的初步處理及分析。本書是國內(nèi)第一本詳細(xì)闡述新一代基因組、轉(zhuǎn)錄組等測序技術(shù)的中文書,包含了目前**的技術(shù)資料,極具實(shí)用性和可操作性。
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目 錄
第一章 測序技術(shù)發(fā)展概述1
第一節(jié) 第一代基因測序方法簡介1
第二節(jié) 新一代測序技術(shù)概述4
參考文獻(xiàn)21
第二章 Illumina測序建庫25
第一節(jié) DNA測序建庫25
第二節(jié) 轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)建庫80
第三節(jié) 小RNA測序建庫163
第四節(jié) 簡化基因組測序建庫184
第五節(jié) 目標(biāo)序列捕獲測序建庫204
第六節(jié) 單細(xì)胞測序建庫227
參考文獻(xiàn)244
第三章 Illumina儀器操作246
第一節(jié) 簇生成操作流程246
第二節(jié) 測序儀HiSeq操作流程254
第三節(jié) 測序儀MiSeq操作流程268
第四節(jié) 測序儀NextSeq500 操作流程276
參考文獻(xiàn)283
第四章 Illumina測序數(shù)據(jù)分析方法簡介284
第一節(jié) 下機(jī)數(shù)據(jù)的初步處理284
第二節(jié) DNA測序數(shù)據(jù)分析簡介291
第三節(jié) 轉(zhuǎn)錄組測序標(biāo)準(zhǔn)信息分析304
第四節(jié) 建造中等高性能計(jì)算機(jī)群系統(tǒng)316
參考文獻(xiàn)323
第五章 PacBio RS測序技術(shù)326
第一節(jié) PacBio RS測序原理326
第二節(jié) PacBio RS測序DNA樣品準(zhǔn)備及文庫構(gòu)建流程328
第三節(jié) SMRT Potal二級(jí)分析軟件的安裝333
第四節(jié) SMRT Portal數(shù)據(jù)分析流程334
第五節(jié) PacBio RS測序應(yīng)用簡介348
第六節(jié) PacBio測序案例349
參考文獻(xiàn)350
常用英文簡寫列表351