本書概述了傳染病信息學(xué)框架、體系和相關(guān)技術(shù)基礎(chǔ),詳細(xì)闡述了傳染病時(shí)空數(shù)據(jù)分析,傳播動(dòng)力學(xué)模型方法,復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)中傳染病傳播建模的原理、方法和應(yīng)用。在傳染病監(jiān)測(cè)預(yù)警方法基礎(chǔ)上,結(jié)合生物信息學(xué)及互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)等方面的發(fā)展,重點(diǎn)介紹了基于基因組學(xué)和互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)的傳染病信息學(xué)研究進(jìn)展及相關(guān)預(yù)測(cè)預(yù)警新技術(shù),并在傳染病監(jiān)測(cè)技術(shù)基礎(chǔ)上進(jìn)一步介紹了傳染病信息學(xué)在維護(hù)全球生物安全以及擴(kuò)展應(yīng)用到生物監(jiān)測(cè)的有關(guān)情況,最后總結(jié)了傳染病信息學(xué)當(dāng)前面臨的主要挑戰(zhàn)以及在全球化時(shí)代傳染病信息學(xué)2.0的發(fā)展方向。
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目錄
第1章 概論 1
1.1 導(dǎo)言 1
1.2 概述 3
第2章 傳染病信息學(xué)技術(shù)基礎(chǔ) 9
2.1 傳染病的流行強(qiáng)度 9
2.2 傳染病流行的三種基本特征 10
2.3 傳染病信息學(xué)技術(shù)方法的框架結(jié)構(gòu) 12
2.4 傳染病信息學(xué)的時(shí)空數(shù)據(jù)分析方法 16
2.5 傳染病信息學(xué)分析的操作流程 18
第3章 傳染病監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)的空間分析 23
3.1 疫區(qū)范圍的幾何特征分析 23
3.2 空間相關(guān)性分析 26
3.3 點(diǎn)模式分析 31
3.4 空間回歸分析 33
第4章 傳染病動(dòng)力學(xué)模型 37
4.1 經(jīng)典SIR模型 37
4.2 SEIR模型的改進(jìn) 45
4.3 案例分析:2003年廣州市SARS流行 50
第5章 基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的傳染病傳播模型 57
5.1 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模型 57
5.2 基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模型的傳染病防控研究 63
5.3 小結(jié) 70
第6章 傳統(tǒng)傳染病監(jiān)測(cè)預(yù)警技術(shù) 74
6.1 傳染病監(jiān)測(cè)預(yù)警探測(cè)算法 74
6.2 相關(guān)案例:ESSENCE Ⅱ 82
6.3 小結(jié) 87
第7章 新型傳染病監(jiān)測(cè)預(yù)警技術(shù) 90
7.1 基于基因組學(xué)的傳染病溯源與預(yù)測(cè)預(yù)警技術(shù) 90
7.2 基于互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)的傳染病監(jiān)測(cè)預(yù)警技術(shù) 103
第8章 全球生物安全與生物監(jiān)測(cè) 119
8.1 導(dǎo)言 119
8.2 生物安全威脅及其對(duì)國(guó)家安全的影響 120
8.3 全球生物安全監(jiān)測(cè)策略 124
8.4 當(dāng)前生物監(jiān)測(cè)面臨的挑戰(zhàn) 128
8.5 建立高效全球生物監(jiān)測(cè)系統(tǒng) 130
8.6 全球生物監(jiān)測(cè)系統(tǒng)的展望 132
8.7 小結(jié) 133
第9章 傳染病信息學(xué)面臨的挑戰(zhàn)與發(fā)展方向 137
9.1 傳染病信息學(xué)1.0與傳染病信息學(xué)2.0 139
9.2 傳染病信息學(xué)1.0面臨的挑戰(zhàn) 140
9.3 傳染病信息學(xué)2.0的發(fā)展方向 142
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