精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是通過利用組學(xué)和大數(shù)據(jù)分析技術(shù)，深入和精細(xì)認(rèn)識疾病及導(dǎo)致患者個體發(fā)病的關(guān)聯(lián)因素，通過實(shí)施個性化治療，獲得更好療效的一門新興學(xué)科。與經(jīng)典的醫(yī)學(xué)相比，主要突出以下特征：在既往醫(yī)學(xué)研究基礎(chǔ)上，整合利用基因組學(xué)、代謝組學(xué)、大數(shù)據(jù)收集與計(jì)算以及生物信息學(xué)等新技術(shù)，獲得對疾病的深刻認(rèn)識；利用大樣本人群開展對某疾病過程的深入分析，從而精確尋找到疾病的原因和治療的靶點(diǎn)；個體和群體研究相互支持，通過個體及同質(zhì)群體分析發(fā)現(xiàn)規(guī)律和個性化特征，挖掘個性化治療方法。在某種程度上，精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)體現(xiàn)為對待相同的病癥表現(xiàn)，實(shí)施不一樣的治療方案，獲得最佳的治療效果。
　　精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是隨著當(dāng)前基因組測序技術(shù)的進(jìn)步、病理檢測分析技術(shù)的提高以及生物信息與大數(shù)據(jù)科學(xué)的應(yīng)用而發(fā)展起來的新型醫(yī)學(xué)研究和治療模式。它能夠?qū)σ环N疾病的不同狀態(tài)和過程進(jìn)行精確亞分類，對疾病和患者定制個性化的精準(zhǔn)治療方案，從而取得更好的療效。
　　同樣地，對于傳染病，也存在著易感性、發(fā)病、治療的個體化問題。傳染病是由機(jī)體感染病原體引起的，其臨床表現(xiàn)是機(jī)體和病原體相互作用的結(jié)果。相同的病原體進(jìn)入不同的個體，可引起從不定殖、無癥狀攜帶到不同疾病程度的各類表現(xiàn)。不同的病原體感染同一個個體，會引起相同或不同的病癥表現(xiàn)。對傳染病的治療，也會因不同的病原體、不同的個體采用不同的治療方案。比如，對于同一種抗生素有些人會產(chǎn)生變態(tài)反應(yīng)，因此對于同種病原細(xì)菌的感染，不同患者使用的抗生素會有所不同。
　　隨著基因組測序、微生物各類組學(xué)和分析技術(shù)的創(chuàng)新應(yīng)用，對于傳染病不同的發(fā)生因素，也有了比以往更深刻、翔實(shí)、精確的認(rèn)識。在傳染病的感染病原體診斷方面，隨著基因組測序技術(shù)和生物信息學(xué)分析方法的不斷發(fā)展，對患者感染病原體的鑒定，已從過去限于已知的、種類有限的病原體檢測，迅速發(fā)展為無須預(yù)判、客觀獲得樣品內(nèi)全部核酸序列并從中尋找病原體的階段，使得對患者感染病原體的識別和診斷準(zhǔn)確性大大提高，并成為發(fā)現(xiàn)高變異和新發(fā)病原體的重要技術(shù)手段。通過多病原體篩查和深度測序等新技術(shù)的應(yīng)用，能夠從不同感染者中發(fā)現(xiàn)更多種類的病原體，甚至是新病原體，提高病原體檢出率。
　　對于病原體本身，基于微生物基因組測序技術(shù)的廣泛應(yīng)用人們已認(rèn)識到，利用既往的微生物學(xué)分類方法，還不能對病原微生物進(jìn)行精確的分類，還需要揭示其不同的生物學(xué)特征。比如，即便屬于同種血清型沙門菌的不同菌株，其基因組序列仍會有所不同且可以攜帶不同的耐藥基因而產(chǎn)生不同的耐藥性。
　　對于暴發(fā)的判別，也不僅僅是把同時期出現(xiàn)相同病癥的患者均納入暴發(fā)病例，即便他們感染了相同生物型別的病原體，而是需要從微生物基因組學(xué)上對這些感染的病原體進(jìn)行精細(xì)的比對分類：感染了具有相同基因組學(xué)特征病原體的那些病例，才可能是暴發(fā)相關(guān)病例，而不能僅僅依靠既往病原生物亞型水平的分類進(jìn)行歸類判斷。
　　對于傳染病的群體接種預(yù)防，人們也已認(rèn)識到接種后不同個體免疫反應(yīng)的差異。其中，個體本身遺傳因素，甚至腸道微生物組成等，均可造成接種疫苗后免疫反應(yīng)性的不同。個性化考慮不同接種者對于同種疫苗的反應(yīng)程度，包括異常反應(yīng)性以及產(chǎn)生保護(hù)性抗體的水平，能夠更為精準(zhǔn)地提高群體接種免疫保護(hù)。
　　因此，當(dāng)今微生物的各類組學(xué)、人體基因組學(xué)、感染免疫分析等生物技術(shù)發(fā)展和大數(shù)據(jù)計(jì)算等信息技術(shù)開發(fā)應(yīng)用，提高了人類對傳染病認(rèn)識、治療和預(yù)防的精準(zhǔn)性。將精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)思維運(yùn)用于傳染病的診斷，結(jié)合當(dāng)前深度測序發(fā)現(xiàn)病原體、多種組學(xué)檢測分析技術(shù)的應(yīng)用，能夠提高病原體的發(fā)現(xiàn)能力，尤其是發(fā)現(xiàn)罕見病原體、新病原體，加深對病原體微生物學(xué)和致病性的認(rèn)識，提高傳染病診斷的客觀性，避免主觀誤判，實(shí)現(xiàn)早期、快速、準(zhǔn)確診斷，實(shí)施個體化精準(zhǔn)治療，發(fā)揮預(yù)防傳播擴(kuò)散的能力。對于以預(yù)防為最終目的的傳染病監(jiān)測，利用微生物分子分型和基因組序列比對分析，能夠獲得疫情流行中更為深刻和確切的病原體變異規(guī)律，并且可利用基因組學(xué)技術(shù)實(shí)現(xiàn)更為精準(zhǔn)的暴發(fā)病例定義、疫情發(fā)現(xiàn)、溯源和預(yù)警能力，尤其是可開展網(wǎng)絡(luò)化病原分子監(jiān)測，產(chǎn)生病原體本身的序列大數(shù)據(jù)和網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測大數(shù)據(jù)，并將之應(yīng)用于傳染病疫情的發(fā)現(xiàn)。另外，通過傳染病發(fā)生與傳播的環(huán)境、社會、媒介等相關(guān)因素的流行病學(xué)大數(shù)據(jù)收集、分析，揭示傳染病傳播的流行病學(xué)規(guī)律，提出更為準(zhǔn)確的預(yù)警，能夠?qū)崿F(xiàn)傳染病監(jiān)測和暴發(fā)發(fā)現(xiàn)與溯源的精準(zhǔn)化。在疫苗接種這一重要預(yù)防傳染病的措施方面，需要充分考慮接種者的個體特征和由此產(chǎn)生的針對相同疫苗的不同反應(yīng)性因素，包括年齡、性別、遺傳等因素，還包括個體免疫狀況和免疫應(yīng)答能力、共棲菌群對免疫應(yīng)答的影響等。優(yōu)化疫苗設(shè)計(jì)與個性化應(yīng)用，提高個體和群體疫苗免疫水平，可提高預(yù)防效果。
　　隨著各類新一代組學(xué)分析與數(shù)據(jù)處理技術(shù)、流行病學(xué)相關(guān)大數(shù)據(jù)收集和計(jì)算技術(shù)的快速發(fā)展與水平提高，人類對傳染病病原體和人體本身及其相互作用、感染與發(fā)病過程、流行發(fā)生與擴(kuò)散、預(yù)警與預(yù)防控制等方面的認(rèn)知能力產(chǎn)生了質(zhì)的飛躍，迅速形成了更為精確、清晰和深入的認(rèn)識，推動傳染病的預(yù)防控制達(dá)到精準(zhǔn)的水平。