泛素家族介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解和細(xì)胞自噬
泛素家族包括近20種成員蛋白，其中泛素介導(dǎo)真核細(xì)胞內(nèi)絕大多數(shù)蛋白質(zhì)通過蛋白酶體進(jìn)行選擇性降解，類泛素蛋白ATG8/LC3則介導(dǎo)細(xì)胞自噬。細(xì)胞自噬通過溶酶體降解錯(cuò)誤折疊蛋白、蛋白質(zhì)聚集物和細(xì)胞器等細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)。邱小波教授等10位學(xué)者于2008年共同編著了《泛素介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解》（共8章）一書。該領(lǐng)域在過去10多年中取得了迅猛發(fā)展，已與生物學(xué)及醫(yī)學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域相互交叉。本書在此基礎(chǔ)上進(jìn)行拓展并增加了自噬的內(nèi)容，以反映過去10多年來該領(lǐng)域的快速發(fā)展，系統(tǒng)而深入地介紹該領(lǐng)域的基本理論、實(shí)驗(yàn)技術(shù)及應(yīng)用前景，共29章。
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目錄
第一章 泛素家族概論 1
第一節(jié) 泛素家族概述 1
第二節(jié) 泛素家族異常與人類疾病 4
第三節(jié) 溶酶體-自噬通路及其在蛋白質(zhì)降解中的作用 5
第四節(jié) 泛素研究的背景與前景 7
第五節(jié) 小結(jié) 11
參考文獻(xiàn) 11
第一篇 泛素-蛋白酶體通路
第二章 泛素化概論 15
第一節(jié) 泛素化的生物化學(xué)基礎(chǔ) 15
第二節(jié) 泛素密碼 25
第三節(jié) 泛素化修飾及其生物學(xué)功能 32
第四節(jié) 蛋白質(zhì)翻譯后修飾之間的對(duì)話 36
參考文獻(xiàn) 40
第三章 泛素和類泛素激活酶 42
第一節(jié) 概述 42
第二節(jié) 泛素激活酶的表達(dá)和純化 44
第三節(jié) 人類擬泛素激活酶APPBP1/UBA3異二聚體復(fù)合物的表達(dá)和純化 44
第四節(jié) 激活酶UBE1L的表達(dá)和純化 48
參考文獻(xiàn) 49
第四章 泛素耦合酶 51
第一節(jié) 概述 51
第二節(jié) 泛素耦合酶UBC4/5家族的表達(dá)和純化 55
第三節(jié) 泛素耦合酶Cdc34、UBC13和MMS2的表達(dá)及純化 59
第四節(jié) 檢測(cè)泛素耦合酶-泛素硫酯中間產(chǎn)物形成的高通量方法 63
參考文獻(xiàn) 66
第五章 泛素連接酶 68
第一節(jié) 概述 68
第二節(jié) 實(shí)驗(yàn)技術(shù) 79
參考文獻(xiàn) 137
第六章 泛素結(jié)合蛋白 140
第一節(jié) 泛素結(jié)合蛋白的特性和種類 141
第二節(jié) 泛素結(jié)合蛋白的功能 144
第三節(jié) 泛素結(jié)合蛋白與人類疾病 146
第四節(jié) 泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域分析方法 147
參考文獻(xiàn) 164
第七章 去泛素化酶 166
第一節(jié) 去泛素化酶的分類 166
第二節(jié) 去泛素化酶的作用機(jī)制 168
第三節(jié) 去泛素化酶的生理和病理功能 171
參考文獻(xiàn) 173
第八章 相素化修飾 175
第一節(jié) 相素化修飾的生物學(xué)作用 175
第二節(jié) 相素化修飾及相關(guān)酶 177
第三節(jié) 相素化修飾相關(guān)基因敲除模型 181
第四節(jié) 相素化修飾與人類疾病 183
第五節(jié) 蛋白質(zhì)相素化修飾分析方法 185
第六節(jié) 相素耦合酶UBC9的表達(dá)、純化和活性鑒定 187
第七節(jié) 熒光共振能量轉(zhuǎn)移方法分析相素化修飾 190
第八節(jié) 小結(jié) 195
參考文獻(xiàn) 195
第九章 擬素化修飾 198
第一節(jié) 概述 198
第二節(jié) 擬素化修飾的蛋白底物 199
第三節(jié) 擬素化修飾與腫瘤 200
第四節(jié) UBC12介導(dǎo)的擬素修飾實(shí)驗(yàn) 206
第五節(jié) COP9信號(hào)體（CSN）的純化 207
第六節(jié) 展望 224
參考文獻(xiàn) 224
第十章 植物蛋白質(zhì)的泛素化修飾 228
第一節(jié) 概述 228
第二節(jié) 植物體外泛素化檢測(cè)修飾研究方法 231
第三節(jié) 植物體內(nèi)快速高效檢測(cè)蛋白泛素化修飾研究方法 238
參考文獻(xiàn) 251
第十一章 植物蛋白質(zhì)的相素化修飾 253
第一節(jié) 概述 253
第二節(jié) 實(shí)驗(yàn)技術(shù) 255
參考文獻(xiàn) 260
第十二章 泛素化蛋白的質(zhì)譜法鑒定 262
第一節(jié) 概述 262
第二節(jié) 泛素化蛋白的富集 264
第三節(jié) 泛素化蛋白的分離 271
第四節(jié) 泛素化蛋白的驗(yàn)證與定量 274
第五節(jié) 實(shí)驗(yàn)技術(shù) 277
參考文獻(xiàn) 288
第十三章 泛素化修飾與表觀遺傳調(diào)控 290
第一節(jié) 概述 290
第二節(jié) 組蛋白泛素化的研究技術(shù) 292
第三節(jié) 組蛋白去泛素化的研究技術(shù) 294
參考文獻(xiàn) 300
第十四章 泛素化修飾調(diào)控細(xì)胞代謝 302
第一節(jié) 泛素化修飾與糖代謝 302
第二節(jié) 泛素化修飾與脂質(zhì)代謝 316
第三節(jié) 泛素化修飾調(diào)控氨基酸代謝 328
第四節(jié) 泛素化調(diào)控核酸代謝 336
第五節(jié) 代謝相關(guān)的信號(hào)通路與泛素化修飾 342
第六節(jié) 小結(jié)與展望 354
參考文獻(xiàn) 355
第十五章 泛素化修飾與細(xì)胞周期調(diào)控 357
第一節(jié) 概述 357
第二節(jié) 細(xì)胞周期的泛素化修飾調(diào)控 361
第三節(jié) 泛素化修飾異常與人類疾病 378
第四節(jié) 實(shí)驗(yàn)技術(shù) 383
參考文獻(xiàn) 388
第十六章 泛素化調(diào)節(jié)細(xì)胞死亡 389
第一節(jié) 細(xì)胞凋亡概述 389
第二節(jié) 細(xì)胞凋亡的調(diào)控 391
第三節(jié) 程序性壞死 408
第四節(jié) 泛素化調(diào)控決定細(xì)胞命運(yùn)走向 409
第五節(jié) 凋亡檢測(cè)方法 411
參考文獻(xiàn) 415
第十七章 泛素化修飾調(diào)控固有免疫信號(hào)通路 418
第一節(jié) 泛素化修飾在TLR信號(hào)通路中的功能 418
第二節(jié) 泛素化修飾在RLR信號(hào)通路中的功能 422
第三節(jié) 泛素化修飾在NLR信號(hào)通路中的功能 427
第四節(jié) 泛素化修飾在STING依賴的信號(hào)通路中的功能 430
第五節(jié) 展望 432
參考文獻(xiàn) 432
第十八章 蛋白酶體的結(jié)構(gòu)與功能 435
第一節(jié) 蛋白酶體的組成與結(jié)構(gòu) 435
第二節(jié) 蛋白酶體的作用機(jī)制 440
參考文獻(xiàn) 447
第十九章 蛋白酶體的活性測(cè)定與純化 449
第一節(jié) 蛋白酶體的活性測(cè)定 449
第二節(jié) 蛋白酶體及其激活物的純化與分析 482
參考文獻(xiàn) 496
第二十章 泛素-蛋白酶體通路與藥物研發(fā) 498
第一節(jié) 概述 498
第二節(jié) 靶向泛素-蛋白酶體系統(tǒng)的小分子抑制劑 500
第三節(jié) PROTAC技術(shù) 518
第四節(jié) 靶向泛素系統(tǒng)的藥物研發(fā)策略 527
第五節(jié) 針對(duì)蛋白酶體的藥物研發(fā) 533
第六節(jié) 展望 543
參考文獻(xiàn) 544
第二篇 細(xì)胞自噬
第二十一章 細(xì)胞自噬概論 549
第一節(jié) 概述 549
第二節(jié) 自噬研究的歷史 551
第三節(jié) 自噬的分子機(jī)制 554
第四節(jié) 自噬在生理學(xué)與疾病中的作用 564
參考文獻(xiàn) 570
第二十二章 自噬的選擇性 577
第一節(jié) 概述 577
第二節(jié) 與Atg8/LC3結(jié)合的受體蛋白 578
第三節(jié) 與Atg5結(jié)合的受體蛋白 585
第四節(jié) 分子伴侶介導(dǎo)的自噬的選擇性降解 586
第五節(jié) 小結(jié)與展望 588
參考文獻(xiàn) 588
第二十三章 泛素及類泛素信號(hào)對(duì)自噬的調(diào)控 592
第一節(jié) 類泛素蛋白介導(dǎo)自噬小體的形成及底物識(shí)別 592
第二節(jié) 泛素介導(dǎo)自噬受體構(gòu)象改變和自噬受體復(fù)合物形成 594
第三節(jié) 泛素介導(dǎo)自噬小體形成和受體對(duì)底物的識(shí)別 596
第四節(jié) 泛素調(diào)控底物轉(zhuǎn)運(yùn)和自噬性降解 597
參考文獻(xiàn) 599
第二十四章 蛋白聚集體自噬 601
第一節(jié) 概述 601
第二節(jié) 聚集體的形成、轉(zhuǎn)運(yùn)、識(shí)別和調(diào)控 602
第三節(jié) 聚集體自噬障礙與疾病 607
第四節(jié) 展望 611
參考文獻(xiàn) 611
第二十五章 線粒體和細(xì)胞器自噬 614
第一節(jié) 線粒體和其他細(xì)胞器自噬 614
第二節(jié) 細(xì)胞器自噬的實(shí)驗(yàn)技術(shù) 622
參考文獻(xiàn) 632
第二十六章 自噬與腫瘤 635
第一節(jié) 自噬抑制腫瘤的發(fā)生發(fā)展 635
第二節(jié) 自噬促進(jìn)腫瘤發(fā)生發(fā)展的作用 637
第三節(jié) 自噬在腫瘤治療中的應(yīng)用 640
參考文獻(xiàn) 642
第二十七章 酵母自噬研究方法 644
第一節(jié) GFP-Atg8剪切實(shí)驗(yàn) 644
第二節(jié) Pho8Δ60堿性磷酸酶實(shí)驗(yàn) 647
第三節(jié) Ape1的成熟 649
第四節(jié) Ape1的動(dòng)力學(xué)研究 650
第五節(jié) 活細(xì)胞觀察GFP-Atg8的循環(huán)周期 653
第六節(jié) 在atg1ts菌株中Atg9的運(yùn)輸 655
參考文獻(xiàn) 657
第二十八章 線蟲的自噬過程及分子機(jī)制 659
第一節(jié) 概述 659
第二節(jié) 線蟲中的細(xì)胞自噬 659
第三節(jié) 線蟲中的自噬實(shí)驗(yàn)技術(shù) 666
參考文獻(xiàn) 672
第二十九章 自噬在臨床的應(yīng)用 675
第一節(jié) 自噬相關(guān)的藥物分類 675
第二節(jié) 自噬相關(guān)藥物作用的信號(hào)通路 682
第三節(jié) 自噬相關(guān)藥物在臨床的應(yīng)用前景 689
參考文獻(xiàn) 695
附錄一 主要專業(yè)名詞英漢對(duì)照 699
附錄二 編委簡(jiǎn)介 707
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