本書內容分為兩個部分，第一部分收集北京中國第一歷史檔案館、臺北故宮博物院以及臺北“中央研究院”歷史語言研究所典藏自康熙六十一年至乾隆四十七年間歷任巡臺御史的全部奏折約400份左右；第二部分收集與清代巡臺御史制度及巡臺御史個人有直接關系的上諭和其他大臣的相關奏折作為“附錄”。