原來(lái)，儒勒·凡爾納的小說(shuō)《海底兩萬(wàn)里》中的世界并非全然虛構(gòu)，尼摩船長(zhǎng)是一位天才英雄。他發(fā)明了許多遠(yuǎn)超人類文明水平的先進(jìn)科技......臨終前，尼摩船長(zhǎng)將自己的發(fā)明和秘密基地托付給了兩個(gè)老朋友——哈丁-潘克洛夫?qū)W院的創(chuàng)始人。希望他們能守護(hù)自己的發(fā)明，不被野心者竊取。兩年前，安娜的父母在一次科考中不幸遇難，只剩下她和哥哥德夫在哈丁-潘克洛夫?qū)W院相依為命。即將結(jié)束高一生活的安娜，必須通過(guò)海上考驗(yàn)才能順利升入高二。就在十幾名高一學(xué)生離開(kāi)學(xué)校不久，學(xué)校突然遭到敵校“蘭德學(xué)院”的毀滅性攻擊，瞬間消失。為了逃過(guò)敵校的追殺，重建學(xué)院，安娜和教授帶領(lǐng)幸存者們登船，駛往傳說(shuō)中尼摩船長(zhǎng)的秘密基地。在這里，安娜第一次發(fā)現(xiàn)了自己的傳奇身世——她才是能打開(kāi)秘密基地的“天選之人”……