定 價：69.8 元
叢書名：高等農(nóng)林院校生命科學(xué)基礎(chǔ)課程系列校材
- 作者：廖明幟
- 出版時間：2007/8/1
- ISBN：9787030786272
- 出 版 社：科學(xué)出版社
- 中圖法分類：Q811.4
- 頁碼：286
- 紙張：
- 版次：1
- 開本：16
本教材涵蓋了生物信息學(xué)的核心知識和常見應(yīng)用領(lǐng)域。從序列比對到數(shù)據(jù)庫搜索，再到系統(tǒng)發(fā)育分析、基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組和宏基因組數(shù)據(jù)分析，以及蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)分析等，每一章都以通俗易懂的方式介紹了相關(guān)概念、原理和方法。本教材涵蓋了生物信息學(xué)的核心知識和常見應(yīng)用領(lǐng)域。從序列比對到數(shù)據(jù)庫搜索，再到系統(tǒng)發(fā)育分析、基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組和宏基因組數(shù)據(jù)分析，以及蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)分析等，每一章都以通俗易懂的方式介紹了相關(guān)概念、原理和方法。
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2006年本科畢業(yè)于西北大學(xué)數(shù)學(xué)系，2011年畢業(yè)于哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)院，同年進(jìn)入西北農(nóng)林科技大學(xué)生命學(xué)院工作。
目錄
第一章 緒論1
第一節(jié) 生物信息學(xué)的概念1
第二節(jié) 生物信息學(xué)的歷史2
第三節(jié) 為什么要學(xué)生物信息學(xué)4
第四節(jié) 生物信息學(xué)的方向和應(yīng)用領(lǐng)域4
第五節(jié) 如何學(xué)習(xí)生物信息學(xué)6
第二章 生物信息學(xué)數(shù)據(jù)資源8
第一節(jié) 數(shù)據(jù)庫概述8
第二節(jié) 核酸數(shù)據(jù)庫9
第三節(jié) 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫15
第四節(jié) 基因組數(shù)據(jù)庫21
第五節(jié) 其他生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫23
第三章 序列比對25
第一節(jié) 序列比對概述25
第二節(jié) 序列比對的評分體系27
第三節(jié) 雙序列比對方法35
第四節(jié) 多序列比對方法40
第四章 數(shù)據(jù)庫搜索48
第一節(jié) 數(shù)據(jù)庫搜索概述48
第二節(jié) 基本局部比對搜索工具49
第三節(jié) 高級數(shù)據(jù)庫搜索56
第五章 系統(tǒng)發(fā)育分析60
第一節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育概述60
第二節(jié) 分子系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建方法65
第三節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育樹的評估73
第六章 自然選擇的檢驗(yàn)75
第一節(jié) 生物進(jìn)化重要理論概述75
第二節(jié) 氨基酸位點(diǎn)的適應(yīng)性進(jìn)化77
第三節(jié) 特定位點(diǎn)和分支的適應(yīng)性進(jìn)化83
第四節(jié) 群體自然選擇檢驗(yàn)86
第七章 基因組學(xué)90
第一節(jié) 基因組學(xué)概論90
第二節(jié) 基因組分析93
第三節(jié) 基因組學(xué)研究方向及應(yīng)用106
第八章 轉(zhuǎn)錄組學(xué)111
第一節(jié) 轉(zhuǎn)錄組概述111
第二節(jié) RNA-seq實(shí)驗(yàn)和分析的基本思路112
第三節(jié) 轉(zhuǎn)錄組常用數(shù)據(jù)庫125
第九章 蛋白質(zhì)組學(xué)128
第一節(jié) 蛋白質(zhì)組學(xué)概述128
第二節(jié) 蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)的產(chǎn)生130
第三節(jié) 蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)的分析138
第十章 代謝組學(xué)149
第一節(jié) 代謝組學(xué)概述149
第二節(jié) 代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理的常用方法152
第三節(jié) 代謝組學(xué)分析工具和數(shù)據(jù)庫概述161
第四節(jié) 代謝組學(xué)分析工具——MetaboAnalyst167
第十一章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)計算175
第一節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類175
第二節(jié) 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測179
第三節(jié) 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測188
第四節(jié) 展望192
第十二章 表觀基因組學(xué)194
第一節(jié) 表觀基因組概述194
第二節(jié) DNA甲基化194
第三節(jié) 組蛋白修飾198
第四節(jié) RNA修飾204
第五節(jié) 常見表觀基因組數(shù)據(jù)資源及工具210
第十三章 宏基因組215
第一節(jié) 宏基因組概述215
第二節(jié) 宏基因組數(shù)據(jù)的產(chǎn)生217
第三節(jié) 宏基因組數(shù)據(jù)的分析221
第四節(jié) 宏基因組數(shù)據(jù)的相關(guān)資源與工具229
第十四章 非編碼RNA235
第一節(jié) 非編碼RNA概述235
第二節(jié) miRNA的生物信息學(xué)分析238
第三節(jié) lncRNA的鑒別及分析240
第四節(jié) circRNA的鑒別及分析243
第十五章 系統(tǒng)生物學(xué)246
第一節(jié) 系統(tǒng)生物學(xué)概述246
第二節(jié) 常見分子生物網(wǎng)絡(luò)248
第三節(jié) 系統(tǒng)生物學(xué)的建模策略254
第四節(jié) 生物分子網(wǎng)絡(luò)分析259
第五節(jié) 系統(tǒng)生物學(xué)數(shù)據(jù)資源和工具268
主要參考文獻(xiàn)270
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