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英杏沙杏圖鑒及分子身份證
本書基于建設(shè)新疆英吉沙杏國家林木種質(zhì)資源庫平臺,書中內(nèi)容依進(jìn)化樹的順序關(guān)系按不同顏色進(jìn)行編排分成11類,主要以杏花、杏果實(shí)拍照片及手繪圖進(jìn)行展示,并按其生物學(xué)特性輔以文字描述,目的是明確所收集的栽培杏品種的譜系關(guān)系。對121個(gè)杏品種的基因組重測序數(shù)據(jù)進(jìn)行變異檢測,獲得備選單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SMP),根據(jù)缺失率、次等位基因頻率以及多態(tài)性等指標(biāo)對SMP位點(diǎn)進(jìn)行過濾,通過計(jì)算篩選區(qū)分出121份杏種質(zhì)的最少SNP位點(diǎn)組合,根據(jù)基因型對這些SNP位點(diǎn)賦值,使用數(shù)值組合構(gòu)建出每個(gè)品種特有的分子身份證。同時(shí)使用篩選出的SNP位點(diǎn)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,鑒定出與杏仁高氨基酸含量關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),進(jìn)一步篩選出高杏仁氨基酸含量的杏品種。并在此基礎(chǔ)上采用國際栽培植物命名法,完成杏品種的命名。
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