本書介紹了人工金屬酶的發(fā)展歷程及其常用的分子設(shè)計方法,系統(tǒng)總結(jié)了近十年人工金屬酶設(shè)計領(lǐng)域取得的研究進展,分別介紹了含3d過渡金屬元素(鐵、鈷、鎳、銅、鋅、錳)以及含4d/5d過渡金屬元素(鉬、釕、銠、鋨和銥)等人工金屬酶的分子設(shè)計及其在生物催化等領(lǐng)域中的應(yīng)用。本書基于國內(nèi)外人工金屬酶研究典型案例,探討了不同人工金屬酶的分子設(shè)計方法、結(jié)構(gòu)與催化功能關(guān)系以及分子設(shè)計的新趨勢和應(yīng)用前景等。
本書可作為高等院校化學(xué)生物學(xué)、生物工程以及生物技術(shù)等專業(yè)高年級本科生、碩士和博士研究生以及教師的參考用書,同時也可以供相關(guān)科研院所的科研工作者參考。
林英武,南華大學(xué)教授,博士生導(dǎo)師。復(fù)旦大學(xué)博士,美國伊利諾伊大學(xué)香檳分校博士后,日本奈良先端科技大學(xué)JSPS訪問學(xué)者,湖南省121創(chuàng)新人才。先后主持國家自然科學(xué)基金青年項目和面上項目、湖南省杰出青年基金項目等,長期從事血紅素蛋白結(jié)構(gòu)與功能以及人工金屬酶分子設(shè)計與應(yīng)用等研究,相關(guān)科研成果發(fā)表于Nature、PNAS、JACS、Angew Chem、ACS Catalysis、中國科學(xué)(化學(xué))等SCI論文累計200余篇。2022年入選中國化學(xué)會第四屆生物物理化學(xué)專業(yè)委員會委員,2024年入選SCI期刊J Inorg Biochem編委,2022-2024年連續(xù)入選斯坦福大學(xué)全球前2%dingjian科學(xué)家榜單。
第1章 人工金屬酶及其分子設(shè)計簡介 001
1.1 生物酶與金屬酶簡介 003
1.2 人工金屬酶及其發(fā)展歷程 004
1.3 人工金屬酶分子設(shè)計方法 008
1.4 基于肌紅蛋白和神經(jīng)紅蛋白的分子設(shè)計與應(yīng)用 011
1.4.1 理性設(shè)計與研究案例 012
1.4.2 定向進化與研究案例 024
1.4.3 半理性設(shè)計與研究案例 028
1.5 小結(jié) 034
參考文獻 034
第2章 含鐵(Fe)人工金屬酶設(shè)計與應(yīng)用 043
2.1 含鐵天然酶簡介 045
2.2 含血紅素及其類似物人工金屬酶 047
2.2.1 血紅素衍生物與天然蛋白組裝及其在生物催化中的應(yīng)用 047
2.2.2 血紅素類似物與天然蛋白組裝及其在有機合成中的應(yīng)用 052
2.2.3 血紅素與非天然蛋白組裝及其在環(huán)境催化和有機合成中的應(yīng)用 055
2.3 其他含F(xiàn)e- 配合物的人工金屬酶 058
2.4 含鐵離子的人工金屬酶 060
2.4.1 單鐵離子活性中心及其在生物催化中的應(yīng)用 060
2.4.2 雙鐵離子活性中心及其在生物催化中的應(yīng)用 061
2.5 含硫鐵簇的人工金屬酶 063
2.5.1 作為電子傳遞中心及其在生物催化中的應(yīng)用 063
2.5.2 作為生物催化中心及其在生物能源中的應(yīng)用 064
2.6 小結(jié) 067
參考文獻 068
第3章 含鈷(Co)人工金屬酶設(shè)計及應(yīng)用 073
3.1 含鈷天然酶簡介 075
3.2 人工甲基轉(zhuǎn)移酶 077
3.3 人工Co- 氫化酶 078
3.4 含Co 的人工CO2 還原酶 082
3.5 人工Co- 氧化酶 085
3.5.1 非共價鍵方法 085
3.5.2 共價鍵方法 087
3.6 小結(jié) 088
參考文獻 089
第4章 含鎳(Ni)人工金屬酶設(shè)計及應(yīng)用 093
4.1 含鎳天然酶簡介 095
4.2 人工Ni- 超氧化物歧化酶 097
4.2.1 Ni-SOD 模型化合物 097
4.2.2 Ni-SOD 人工金屬酶 099
4.3 人工Ni- 氫化酶 101
4.3.1 [NiFe]- 氫化酶啟發(fā)的分子設(shè)計 101
4.3.2 基于金屬蛋白的分子設(shè)計 103
4.4 含Ni 的人工CO2 還原酶 104
4.5 人工皮素氧化酶 106
4.6 人工甲基- 輔酶M 還原酶 107
4.7 其他鎳- 人工金屬酶分子設(shè)計與應(yīng)用 109
4.8 小結(jié) 112
參考文獻 112
第5章 含銅(Cu)人工金屬酶設(shè)計及應(yīng)用 115
5.1 含銅天然酶簡介 117
5.2 人工Cu- 氧化酶 119
5.2.1 基于天然蛋白的分子設(shè)計及其在生物催化中的應(yīng)用 119
5.2.2 基于多肽分子組裝及其在生物催化中的應(yīng)用 121
5.3 人工Cu-NIR 酶 122
5.4 含Cu 的人工Diels-Alder 加成酶 125
5.4.1 單金屬中心及其在有機合成中的應(yīng)用 125
5.4.2 雙金屬中心及其在有機合成中的應(yīng)用 127
5.5 人工Friedel-Crafts 反應(yīng)酶 128
5.6 人工Michael 加成酶 130
5.7 小結(jié) 132
參考文獻 133
第6章 含鋅(Zn)人工金屬酶設(shè)計及應(yīng)用 137
6.1 含鋅天然酶簡介 139
6.2 人工水解酶 140
6.2.1 基于三股α 螺旋 140
6.2.2 基于四股α 螺旋 142
6.2.3 基于天然鋅指蛋白 144
6.2.4 基于其他天然含鋅酶 144
6.2.5 基于蛋白質(zhì)/ 多肽組裝界面 145
6.3 人工核酸酶 147
6.4 含Zn 的人工Diels-Alder 加成酶 148
6.5 小結(jié) 150
參考文獻 150
第7章 含錳(Mn)人工金屬酶設(shè)計及應(yīng)用 153
7.1 含錳天然酶簡介 155
7.2 人工Mn- 過氧化物酶 156
7.3 人工Mn- 氧化酶 159
7.4 人工Mn- 氫化酶 162
7.5 小結(jié) 164
參考文獻 165
第8章 含4d/5d 過渡金屬元素的人工金屬酶設(shè)計與應(yīng)用 169
8.1 含金屬鉬(Mo)的人工金屬酶 171
8.2 含金屬釕(Ru)的人工金屬酶 173
8.2.1 在有機合成中的應(yīng)用 174
8.2.2 在生物傳感中的應(yīng)用 176
8.2.3 在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用 176
8.3 含金屬銠(Rh)的人工金屬酶 180
8.3.1 非共價組裝及其在有機合成中的應(yīng)用 180
8.3.2 共價結(jié)合及其在有機合成中的應(yīng)用 182
8.4 含金屬鋨(Os)的人工金屬酶 183
8.5 含金屬銥(Ir)的人工金屬酶 186
8.6 小結(jié) 189
參考文獻 190
第9章 人工金屬酶分子設(shè)計總結(jié)與展望 193
9.1 人工金屬酶分子設(shè)計總結(jié) 195
9.2 人工金屬酶分子設(shè)計展望 197
參考文獻 198