本書由紙質教材和數(shù)字課程兩部分組成。紙質部分共分5篇16章,分別介紹觀察細胞、細胞器和大分子的技術、操作細胞及其大分子的技術、分析細胞及其大分子的技術、分析細胞基本活動的綜合技術及分析細胞信號轉導的綜合技術,每章重點展示細胞生物學常用實驗技術的基本原理、基本操作過程及應用舉例。數(shù)字課程部分鏈接成熟的技術步驟細節(jié)介紹,推介應用該技術解決科學問題的典型文獻,該技術發(fā)明的歷史和人物介紹,并附自測題供學生練習和思考。本書適用于高等醫(yī)學院校本科生、研究生、醫(yī)學行業(yè)工作人員以及相關研究人員。
編寫本書的目的是為醫(yī)學院校的兩類人群——醫(yī)學生以及研究生或研究人員——概要地展示醫(yī)學細胞生物學實驗技術,其中既包括那些經典而依然常用的單元技術,也包括新興的和整合的技術。我們不是想要提供一份操作手冊般可供直接使用的技術步驟指導,而是啟發(fā)讀者思考:一人們在面對未知科學問題時是怎樣創(chuàng)造和設計了各種基于細胞的技術手段的;選用什么技術可以解決實際問題;為什么這樣選;大致上怎么做?
為什么細胞生物學實驗技術與醫(yī)學相關
細胞生物學是研究細胞基本生命活動規(guī)律的科學,因此必然與醫(yī)學有著密切的聯(lián)系。有趣的是,研究細胞的方法和技術從誕生伊始就與醫(yī)學密切相關。三個多世紀以前,英國物理學家R.Hooke在1665年出版了《顯微圖譜》一書,描述了他用自己制作的光學顯微鏡(透鏡組合)觀察到木栓切片時發(fā)現(xiàn)的蜂窩狀小孔結構,他把這種小孔稱為“cell”(小室)。顯然,他看到的“cell”實際上是由植物細胞壁所圍成的空腔,因此他當時并沒有發(fā)現(xiàn)真正的細胞,只是提出了“cell”這個名詞。真正發(fā)現(xiàn)細胞的是同時代的荷蘭科學家A.Leeuwenhoek,他在1674年用自制的光學顯微鏡觀察到池塘水滴中的原生動物細胞,并在其后的觀察中發(fā)現(xiàn)了哺乳動物和人類的精子、鮭魚紅細胞的細胞核、牙垢中的細菌等。毫無疑問,這些發(fā)現(xiàn)必然導致Leeuwenhoek及其同時代的人們思考那些畸形的精子和牙垢中的細菌與人類的生殖和口腔疾病的關聯(lián)。
19世紀細胞學說的建立和細胞病理學的形成,使人們對人體和疾病的認識進入細胞水平,從而為現(xiàn)代醫(yī)學的發(fā)展奠定了基礎。醫(yī)院里所有活檢和手術標本都要接受顯微鏡檢查(病理學檢查)的程序沿用至今,其觀察結果一直是疾病診斷最重要的依據之一,同時成為人類認識疾病發(fā)生和發(fā)展過程的知識來源。20世紀細胞生物學和分子生物學的發(fā)展,進一步使醫(yī)學研究深入到分子水平,對人體和疾病的認識也上升到更加本質的層次。例如,一些疾病的病理診斷依賴電子顯微鏡、免疫組織化學、流式細胞術、聚合酶鏈反應(PCR)等技術,這些都屬于分子細胞生物學技術。從研究疾病的角度講,現(xiàn)代醫(yī)院,特別是研究型大學附屬的教學醫(yī)院(被稱為學術型醫(yī)院“acadenuc hospital”),普遍成立了各種實驗室和研究所,對各科疾病進行機制和防治的研究,其基本手段不可避免地包括細胞生物學技術,例如細胞培養(yǎng)、基因表達和功能分析等。甚至,細胞生物學技術已經用于人類疾病的治療,這方面突出的例子是人體器官和組織的修復和再造中采用的組織工程(tissue engineering)技術和干細胞技術,如將源于自體的干細胞誘導分化并與材料整合移植到體內,修補皮膚、軟骨、骨和肌腱等,這類技術的
第一篇 觀察細胞、細胞器和大分子的技術
第一章 顯微鏡技術
第一節(jié) 光學顯微鏡
第二節(jié) 激光掃描共聚焦顯微鏡
第三節(jié) 超高分辨率熒光顯微鏡技術
第四節(jié) 活細胞熒光工作站
第五節(jié) 電子顯微鏡
第六節(jié) 原子力顯微鏡
第二章 細胞化學技術
第一節(jié) 酶細胞化學技術
第二節(jié) 免疫細胞化學技術
第三節(jié) 原位雜交技術
第二篇 操作細胞及其大分子的技術
第三章 細胞結構成分的離心分離技術
第一節(jié) 差速離心法
第二節(jié) 密度梯度離心法
第四章 細胞培養(yǎng)技術
第五章 細胞工程技術
第一節(jié) 細胞融合技術
第二節(jié) 核酸分子導入細胞的技術
第三篇 分析細胞及其大分子的技術
第六章 流式細胞術
第一節(jié) 分析式流式細胞術
第二節(jié) 分選式流式細胞術
第七章 組織和細胞顯微圖像分析技術
第一節(jié) 組織和細胞幾何參數(shù)的分析
第二節(jié) 熒光和染色的信號強度和陽性面積分析
第八章 定量分析mRNA的技術
第一節(jié) RT-PCR技術
第二節(jié) real-time PCR技術
第九章 分析蛋白質的技術
第一節(jié) 免疫印跡
第二節(jié) 免疫共沉淀
第三節(jié) 熒光共振能量轉移(FRET)技術
第四篇 分析細胞基本活動的綜合技術
第十章 檢測細胞增殖
第一節(jié) MTT法和CCK8法
第二節(jié) Brd〔J參入法
第三節(jié) 細胞周期分析
第十一章 檢測細胞衰老和死亡
第一節(jié) 衰老相關的β-半乳糖苷酶染色
第二節(jié) AnnexinV標記
第三節(jié) TUNEL標記
第十二章 檢測細胞自噬
第一節(jié) 自噬過程和水平的電鏡分析
第二節(jié) LC3-II水平和LC3點狀定位的檢測
第三節(jié) 自噬流的評估
第十三章 檢測細胞黏附和遷移
第一節(jié) 細胞一基質黏附實驗
第二節(jié) Transwell實驗
第三節(jié) 劃痕實驗
第五篇 分析細胞信號轉導的綜合技術
第十四章 分析蛋白質修飾和活性
第一節(jié) 分析蛋白質修飾的方法(以磷酸化和SLJMO化修飾為例)
第二節(jié) 分析酶活性的方法(以激酶和SUMO蛋白酶為例)
第三節(jié) 分析轉錄因子活性的方法
第十五章 干預基因的表達和功能
第一節(jié) 野生型、截短體或突變體基因的強制過度表達
第二節(jié) 基因沉默和敲除
第十六章 分析蛋白質相互作用來驗證蛋白質的功能和上下游關系
第一節(jié) 基因表達干預下的免疫共沉淀分析
第二節(jié) 基因表達干預下的蛋白質定位和相互作用分析
附錄 綜合實驗:分析A基因對腫瘤細胞凋亡耐受的影響
實驗一 腫瘤細胞的傳代培養(yǎng)
實驗二 pEGFP-A基因表達質粒的轉染
實驗三 轉染細胞的熒光顯微鏡觀察
實驗四 轉染細胞的活力檢測
實驗五 流式細胞儀檢測細胞凋亡
《醫(yī)學細胞生物學常用技術:原理和應用》:
第一節(jié) 組織和細胞幾何參數(shù)的分析
組織和細胞幾何參數(shù)的分析是圖像分析處理中最常用的方法。
【技術方法與步驟】
通過不同的樣品制備和染色方法得到組織和細胞的切片,在適當?shù)娘@微鏡物鏡倍率下,選取所需的視野。通過數(shù)碼相機采集圖像,通過圖像樣本的灰度直方圖,我們可區(qū)分不同細胞組分的灰度閾值,經追蹤處理后識別出各組分的邊界,進而檢測它們的面積、周長、形態(tài)因子等幾何參數(shù)。
例如,在進行細胞核質比分析時,根據染色標本內不同組分灰度直方圖確定核質各自灰度峰值,設定區(qū)分的閾值范圍,分別測量細胞核和細胞質面積,可得到準確的核質比。通過對血管顯微圖像作形態(tài)分析和邊界檢測,可區(qū)分血管外膜、外彈力膜、中膜、內彈力膜、內膜和空腔的幾何參數(shù),從而測定它們的面積、周長和血管壁厚度,換算出它們之間的各種比例,用于心血管疾病的常規(guī)檢測。通過對骨小梁、骨痂、成骨細胞等骨成分形態(tài)分析和比例測試,測定面積、周長、寬度和密度,換算出骨的體積參數(shù),通過四環(huán)素熒光雙標記,確定骨生長率,可以判別各種治療方法對骨質疏松的治療效果。對骨髓腔做連續(xù)CT片和骨小梁的連續(xù)骨片,通過圖像處理后分析各組分的邊界輪廓,經三維重建后能建立三維立體圖像,分析圖像的內部剖面形態(tài)結構,檢測幾何形態(tài)參數(shù)。
【應用舉例】
骨小梁的幾何參數(shù)測量
●目的測量骨小梁面積,判斷骨手術或藥物治療后骨質疏松的情況。
●材料、試劑和方法骨小梁切片通過HE染色,在10倍物鏡下選取若干個視野,原圖通過對比度增強,突出骨小梁的顯色。選取適當灰度閾值后,經二值化處理后生成黑白二值圖,再經腐蝕膨脹等二值化處理方法清除骨小梁邊緣的粘連雜質,然后通過擦碎片和填洞得到完整骨小梁白色圖像。最后經骨小梁特征提取后,選擇所需幾何參數(shù)進行測量,如面積、周長、厚度、骨小梁面積密度、骨小梁間距、節(jié)點數(shù)以及游離末端數(shù)等。
通過對不同組別的樣品做圖像處理,可得到一系列的分組數(shù)據,進行組間比較后,可對藥物療效、手術處理后的新骨生長和形成效果加以判斷。
第二節(jié) 熒光和染色的信號強度和陽性面積分析
圖像分析常用于定性和半定量測量,分析顯色物所反映的生物大分子的表達水平,測定待測物質的面積密度(面積百分比)和數(shù)量密度(數(shù)量百分比),常用于待測物質的陽性表達率和特定區(qū)域的分布水平分析,如免疫組化、酶標記、原位雜交分析等,同時也適用于同位素標記的放射自顯影等各類標記的檢測和銀顆粒分析的檢測!炯夹g方法與步驟】定量分析是顯微圖像分析最重要的應用手段,細胞經免疫細胞化學、原位雜交或特殊染色后,可以測定細胞內DNA、RNA和蛋白質等的相對含量,其原理是建立在朗玻一比爾(Lambert-Beer)定律基礎上,細胞吸收光度取決于細胞內物質對特定波長光線能量的吸收能力。通過測量物質透光性,換算成光密度值來進行定量分析。因此圖像分析需建立灰度值和光密度含量閾值轉換表,通過對灰度的檢測可精確測定待測物的相對含量。酶相對含量也是一種定量分析,可通過檢測酶標記物的灰度值強弱,轉換后進行分析。熒光定量檢測一般要建立熒光標準,常用熒光標準微球或鈾玻璃作為參照物,細胞或組織經熒光標記后,通過對細胞內鈣離子、細胞器、蛋白質和核酸等熒光圖像做灰度值轉換,可以對其熒光光通量做出精確的定量分析,由于標記方法的不同,還可做多熒光標記的分析測量。目前常用現(xiàn)成的圖像處理軟件進行操作和分析。
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