從20世紀(jì)90年代開始，隨著計算機(jī)技術(shù)的迅速發(fā)展以及藥物化學(xué)、分子生物學(xué)和計算化學(xué)的發(fā)展，計算機(jī)輔助藥物設(shè)計（CADD）也快速發(fā)展起來，成為一門新興的研究領(lǐng)域。與此同時，CADD的發(fā)展和應(yīng)用，也大大促進(jìn)了藥物設(shè)計和新藥開發(fā)的效率，CADD現(xiàn)在已經(jīng)成為合理藥物設(shè)計中不可或缺的一環(huán)，在藥物設(shè)計中起著越來越重要的作用。因此，CADD方法的理論和應(yīng)用研究具有非常重要的意義。關(guān)于CADD的理論，很多教科書和專著已進(jìn)行大量介紹，適合初學(xué)者學(xué)習(xí)理論知識，但是在實際中的操作，卻鮮有基礎(chǔ)書目可以參考。本書編者長期從事相關(guān)工作，根據(jù)在實際工作中對各種軟件的應(yīng)用，編寫了本書，介紹計算機(jī)輔助藥物設(shè)計時需要用到的部分軟件的使用，以實現(xiàn)設(shè)計目的為導(dǎo)向，著重介紹軟件的操作方法，使用過程中的細(xì)節(jié)與原理，可以使初學(xué)者迅速入門。本書內(nèi)容包含了分子動力學(xué)模擬、分子對接、蛋白質(zhì)同源模建、定量構(gòu)效關(guān)系的研究、藥效團(tuán)的構(gòu)建、虛擬篩選等內(nèi)容，且每一內(nèi)容有不止一個軟件的使用介紹，希望能對入門計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的廣大師生有所幫助。
　　本書的編寫是從初學(xué)者的角度，手把手、一步一步介紹各軟件的使用方法、功能，并配有圖片，使初學(xué)者能夠順利學(xué)習(xí)。使用各種常用軟件。
　　限于編者的水平有限，書中可能存在不妥之處，敬請廣大讀者批評和指正。