生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)及習(xí)題集
定 價：59 元
叢書名：生命科學(xué)與信息技術(shù)叢書
- 作者：馮世鵬 等
- 出版時間：2021/7/1
- ISBN：9787121415104
- 出 版 社：電子工業(yè)出版社
- 中圖法分類：Q811.4-33
- 頁碼：272
- 紙張：
- 版次：01
- 開本：16開
生物信息學(xué)是運(yùn)用生物學(xué)、數(shù)學(xué)、計算機(jī)科學(xué)等多學(xué)科技術(shù)與手段進(jìn)行生物信息的獲取、存儲、分析、利用的一門交叉學(xué)科，是目前生物學(xué)研究的熱門領(lǐng)域之一。本書主要介紹生物信息學(xué)的相關(guān)實(shí)驗(yàn)，并給出對應(yīng)的習(xí)題。全書分為四篇：第一篇講解生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)，共設(shè)計了23個實(shí)驗(yàn)；第二篇為習(xí)題集；第三篇為習(xí)題集參考答案；第四篇提供相關(guān)的名詞解釋。本書附錄部分介紹了常見的模式生物和熱帶植物的主要特點(diǎn)，可供學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的讀者鞏固所學(xué)的生物信息學(xué)知識，并拓展其視野。本書的內(nèi)容主要對應(yīng)《實(shí)用生物信息學(xué)》一書，同時兼顧其他優(yōu)秀的生物信息學(xué)教材。
馮世鵬，男，博士，2009年畢業(yè)于中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院，海南大學(xué)熱帶作物學(xué)院副教授，被海南省人才服務(wù)中心認(rèn)定為拔尖人才，連續(xù)多年為研究生、本科生主講《生物信息學(xué)》課程，同時作為主講教師參與了本科生《分子生物學(xué)》、《生物化學(xué)》等課程的教學(xué)工作，教學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富。已出版專著一部，發(fā)表論文十余篇，申請專利四項(xiàng)。
目 錄
第一篇 生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn) 1
第0章 生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室規(guī)則與安全 2
第1章 文獻(xiàn)檢索 3
實(shí)驗(yàn)1 中文文獻(xiàn)檢索(以中國知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫為例) 4
實(shí)驗(yàn)2 外文文獻(xiàn)檢索(以ScienceDirect數(shù)據(jù)庫為例) 8
第2章 生物信息數(shù)據(jù)庫資源 12
實(shí)驗(yàn)3 核酸數(shù)據(jù)庫檢索(以GenBank數(shù)據(jù)庫為例) 13
實(shí)驗(yàn)4 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫檢索(以UniProt數(shù)據(jù)庫為例) 22
實(shí)驗(yàn)5 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫檢索(以PDB數(shù)據(jù)庫為例) 30
實(shí)驗(yàn)6 基因組數(shù)據(jù)庫檢索(以TAIR數(shù)據(jù)庫為例) 33
實(shí)驗(yàn)7 代謝數(shù)據(jù)庫檢索(以KEGG數(shù)據(jù)庫為例) 38
實(shí)驗(yàn)8 非編碼RNA數(shù)據(jù)庫檢索(以miRBase數(shù)據(jù)庫為例) 44
實(shí)驗(yàn)9 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫檢索(以GEO數(shù)據(jù)庫為例) 47
第3章 序列比對 50
實(shí)驗(yàn)10 在線序列比對實(shí)驗(yàn)(以BLAST、BLAT軟件為例) 50
實(shí)驗(yàn)11 本地序列比對實(shí)驗(yàn)(以BioEdit軟件為例) 54
實(shí)驗(yàn)12 多序列比對實(shí)驗(yàn)(以Clustal軟件為例) 57
第4章 核酸序列分析 61
實(shí)驗(yàn)13 核酸序列常規(guī)分析(以DNAStar軟件為例) 61
實(shí)驗(yàn)14 基因序列元件預(yù)測 63
實(shí)驗(yàn)15 引物設(shè)計分析(以Primer 5.0軟件為例) 67
實(shí)驗(yàn)16 第一代測序數(shù)據(jù)分析 71
第5章 蛋白質(zhì)序列分析 75
實(shí)驗(yàn)17 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析 75
實(shí)驗(yàn)18 蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)分析 79
實(shí)驗(yàn)19 蛋白質(zhì)的修飾分析 82
實(shí)驗(yàn)20 蛋白質(zhì)定位預(yù)測 85
第6章 基因表達(dá)分析 89
實(shí)驗(yàn)21 qPCR數(shù)據(jù)分析 89
第7章 進(jìn)化分析 93
實(shí)驗(yàn)22 進(jìn)化樹構(gòu)建(以MEGA軟件為例) 93
第8章 非編碼miRNA分析 97
實(shí)驗(yàn)23 非編碼miRNA查詢及預(yù)測分析 97
第二篇 生物信息學(xué)習(xí)題集 101
第1章 文獻(xiàn)檢索 102
1.1 知識點(diǎn)介紹 102
1.2 典型例題講解 103
1.3 習(xí)題 105
第2章 生物信息數(shù)據(jù)庫資源 107
2.1 知識點(diǎn)介紹 107
2.2 典型例題講解 111
2.3 習(xí)題 113
第3章 序列比對 119
3.1 知識點(diǎn)介紹 119
3.2 典型例題講解 121
3.3 習(xí)題 122
第4章 核酸序列分析 125
4.1 知識點(diǎn)介紹 125
4.2 典型例題講解 130
4.3 習(xí)題 131
第5章 蛋白質(zhì)序列分析 133
5.1 知識點(diǎn)介紹 133
5.2 典型例題講解 138
5.3 習(xí)題 139
第6章 基因表達(dá)分析 141
6.1 知識點(diǎn)介紹 141
6.2 典型例題講解 144
6.3 習(xí)題 145
第7章 進(jìn)化分析 147
7.1 知識點(diǎn)介紹 147
7.2 典型例題講解 150
7.3 習(xí)題 151
第8章 非編碼miRNA分析 153
8.1 知識點(diǎn)介紹 153
8.2 典型例題講解 156
8.3 習(xí)題 157
第三篇 參考答案 159
第1章 文獻(xiàn)檢索 160
第2章 生物信息數(shù)據(jù)庫資源 163
第3章 序列比對 173
第4章 核酸序列分析 175
第5章 蛋白質(zhì)序列分析 177
第6章 基因表達(dá)分析 183
第7章 進(jìn)化分析 185
第8章 非編碼miRNA分析 186
第四篇 名詞解釋 187
附錄I 常見模式生物基因組信息介紹 207
附錄II 常見熱帶植物基因組信息介紹 240
參考資料 256
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