依照《安貝氏菌物詞典》第10版的分類系統(tǒng)，小菇科隸屬于擔子菌門蘑菇綱蘑菇目，包含11個屬：赤小菇屬、膠孔菌屬、扇形小菇屬、半小菇屬、小菇屬、扇菇屬、脂小菇屬、黏柄小菇屬、元蘑屬、幕府菇屬和干臍菇屬，全世界約有800種，中國有10屬（僅扇形小菇屬未見分布）120余種。在全國20個省（自治區(qū)、直轄市）調查、采集標本的基礎上，本書記載和描述了中國小菇科真菌104種（變種），包括9個新種、1個新組合和30個新記錄種，提供了每個物種的名稱、形態(tài)描述、生境和國內外地理分布，以及宏觀特征、顯微特征的線條圖和擔子體原生態(tài)彩色圖片，文末附系統(tǒng)發(fā)育樹。

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